Di kota Zveropolis, sebuah wabah sedang berkecamuk, yang dibawa oleh tetesan udara. Kelinci Judith juga mengambil infeksi dan sekarang tenggorokannya sangat sakit. Setelah sakit selama beberapa hari dan menyadari bahwa dia tidak akan sembuh, dia memutuskan untuk pergi ke rumah sakit. Anda dalam permainan Judy's Throat Doctor akan menjadi dokter yang merawatnya. Hal pertama yang perlu Anda lakukan adalah memeriksa tenggorokan Judith dan mendiagnosisnya. Kemudian menggunakan berbagai perangkat medis dan obat-obatan Anda akan memulai perawatan. Untuk memfasilitasi proses ini, ada petunjuk dalam game yang akan memberi tahu Anda urutan dan urutan tindakan Anda.