Di Jepang kuno, ada Orde Ninja Warriors yang melawan berbagai musuh negara dan monster. Hari ini kita berada di game Ninja Defender kami akan membantu satu perang untuk memasuki kuil dan memenuhi tugas kepala pesanannya. Pahlawan kita yang melakukan perjalanan melalui kuil akan menembus ke ruang-ruangnya. Dia akan diserang oleh berbagai monster. Karakter kita akan menggunakan senjata seperti bumerang. Menjentikkan itu ke musuh, kami akan memukulnya, dan kemudian benda itu akan terbang kembali. Kami harus memindahkan karakter sehingga dia memukulnya dan dengan demikian membuat lemparan lagi. Jika kita tidak punya waktu untuk melakukan ini, kita akan kehilangan senjata dan kalah putaran.
