Suatu ketika gerbang neraka sudah berhasil mengunci, tetapi roh-roh jahat tidak meninggalkan harapan untuk membebaskan jalan mereka lagi dan mereka berhasil setelah bertahun-tahun. Kali ini mereka membuka portal di Mars dengan harapan manusia tidak dapat segera menemukannya. Tetapi Mars telah dijajah, banyak laboratorium biologi telah menentukannya, dan banyak ilmuwan telah bekerja, semuanya telah mengalami serangan monster yang kejam. Tim penyapu Anda harus menghancurkan monster di Doom 3, dan Anda tidak harus mengambil pengalaman. Pergi ke planet merah dan hati-hati, monster telah menjadi lebih pintar dan lebih kuat.
