Di game Ninja vs Ninja yang baru, Anda akan pergi ke dunia tempat orang-orang di kotak itu tinggal. Ada perang antara dua perintah ninja dan Anda akan bergabung dengan salah satu dari mereka. Karakter Anda adalah pria kotak merah. Dia akan berada di ruangan di mana lawannya berwarna biru. Di antara mereka akan ditemukan berbagai rintangan dan perangkap. Anda harus membimbing karakter Anda melalui semua bahaya ini dan menyerang lawan Anda. Menggunakan berbagai senjata lempar, Anda menghancurkan musuh dan mendapatkan poin untuk itu.
