Di galaksi yang jauh, perang pecah antara dua ras alien. Anda dalam game Clash Of Aliens bergabung dengan salah satu dari mereka dan akan memimpin pasukan. Armada Anda harus bergabung dalam pertempuran melawan skuadron kapal musuh. Anda akan melihat kapal utama Anda di depan Anda di layar. Di bawahnya akan ada panel kontrol. Dengan itu, Anda akan mengirim pilot Anda ke pertempuran di kapal mereka. Mereka menyerang musuh akan menghancurkan mereka dan untuk ini mereka akan memberi Anda poin.
