Terjadi perang antara negara Anda dan negara tetangga. Dalam game Atari Missile Command, Anda akan mengomandoi pertahanan pangkalan militer tempat Anda bertugas. Di depan Anda di layar, Anda akan melihat bangunan markas dan senjata roket dipasang di mana-mana. Musuh telah menembakkan banyak roket ke markas Anda, yang akan muncul di langit. Anda harus menembak mereka semua dan mencegah mereka jatuh ke wilayah pangkalan. Untuk melakukan ini, dengan menggunakan mouse, Anda akan mengatur penglihatan untuk instalasi Anda dengan bantuan salib biru. Tembak jika sudah siap. Jika pandangan Anda akurat, maka Anda akan menembak jatuh rudal musuh dan mendapatkan poin untuk ini. Setelah mengumpulkan sejumlah tertentu, Anda meningkatkan instalasi dan amunisi Anda untuk mereka.