Anak kecil Thomas, bepergian melalui hutan, menemukan Pokemon kecil. Bocah itu berteman dengannya dan sekarang membantu Pokemon tumbuh. Hari ini mereka harus pergi ke padang rumput ajaib dan mendapatkan makanan untuk Pokémon di sana. Di dalam game Pukiimon Anda akan bergabung dengan mereka dalam petualangan ini. Di depan Anda di layar Anda akan melihat tempat terbuka yang terletak di hutan. Makanan akan terbang keluar dari arah yang berbeda. Dia akan muncul pada ketinggian yang berbeda dan terbang dengan kecepatan yang berbeda. Anda harus bereaksi cepat dengan mengkliknya menggunakan mouse. Dengan cara ini, Anda akan membagi objek menjadi bagian yang sama, yang kemudian akan jatuh ke dalam cakar pokemon. Setiap klik Anda akan dievaluasi dengan sejumlah poin.