Di masa depan yang jauh, zombie muncul di dunia piksel setelah serangkaian bencana alam dan perang. Sekarang gerombolan orang mati yang hidup memburu orang-orang yang masih hidup. Di Pixel Zombies Anda akan menjaga salah satu pemukiman manusia. Anda harus menghancurkan kerumunan zombie yang bergerak ke arahnya. Jalan akan terlihat di layar di depan Anda. Zombie akan bergerak di sepanjang itu ke arah Anda dengan kecepatan yang berbeda. Anda perlu mengidentifikasi sasaran prioritas utama dan mulai mengekliknya dengan mouse. Dengan demikian, Anda akan menyerang zombie pilihan Anda dan menghancurkannya. Untuk setiap musuh yang Anda bunuh, Anda akan menerima sejumlah poin.