Sebuah perang pecah di kerajaan laut antara dua orang yang berpura-pura takhta. Dalam perjalanan permusuhan, kedua belah pihak menggunakan detasemen ikan petarung yang terlatih khusus. Dalam game BattleFish, Anda akan bergabung dengan salah satu pihak dan akan memimpin salah satu regu ikan. Lokasi tertentu yang terletak di bawah air akan terlihat di layar di depan Anda. Di satu sisi akan ada ikan pertempuran Anda, dan di sisi lain musuh. Di bagian bawah akan ada panel kontrol khusus dengan ikon. Dengan bantuan mereka, Anda akan mengarahkan tindakan pasukan Anda. Anda harus hati-hati memeriksa ikan musuh dan memilih target Anda untuk menyerangnya. Ikan Anda akan bersama-sama menyerang dan menghancurkan musuh. Untuk ini, Anda akan menerima poin.