Sebuah perang telah dimulai antara klan ninja yang mendukung berbagai pihak dalam perjuangan antara kekuatan Terang dan Gelap. Anda dalam game Ninja Legend akan membantu pahlawan Anda untuk melawan ninja gelap yang menyerang biara, di mana mereka mempersiapkan prajurit dari pasukan ringan. Di depan Anda di layar Anda akan melihat karakter Anda dipersenjatai dengan perisai dan tombak. Tombak musuh akan bergerak ke arahnya. Anda, mengendalikan pahlawan Anda, harus menghitung lintasan lemparan dan melemparkan tombak ke musuh. Jika bidikan Anda tepat, maka tombak tersebut akan mengenai musuh dan menghancurkannya. Tombak juga akan dilemparkan ke pahlawan Anda. Anda harus menggunakan perisai Anda untuk melawan mereka. Juga, pahlawan Anda dapat menggunakan berbagai kemampuan magis untuk melindungi atau menyerang musuh.
