Thomas the Tank Engine dan teman-temannya memutuskan untuk menguji ingatan mereka. Anda dalam permainan Thomas and Friends Mix Up akan bergabung dengan mereka dalam kesenangan ini. Di depan Anda di layar Anda akan melihat lapangan bermain di mana kartu akan diletakkan menghadap ke bawah. Dalam satu gerakan, Anda dapat membalik dua kartu dan melihat gambar di atasnya. Setelah itu, mereka akan kembali ke keadaan semula dan Anda akan bergerak lagi. Tugas Anda adalah menemukan dua gambar identik pada kartu dan membukanya secara bersamaan. Dengan demikian, Anda akan menghapus kartu yang menggambarkannya dari lapangan bermain dan Anda akan diberikan poin untuk ini dalam permainan Thomas and Friends Mix Up. Saat Anda benar-benar mengosongkan bidang kartu, Anda dapat melanjutkan ke level permainan berikutnya.