Seorang penyihir jahat bernama Watchmaker menjerumuskan seorang pria bernama Robin ke dalam tidur abadi dengan bantuan jam ajaib. Setelah itu, dia memecahkan jam dan menyembunyikan semua bagian di rumahnya. Anda dalam game Brother Wake Up harus membantu saudara laki-laki Robin, seorang pria bernama Jack untuk masuk ke rumah Pembuat Jam dan menemukan semua bagian jam. Di depan Anda, karakter Anda akan terlihat di layar yang terletak di salah satu ruangan rumah. Menggunakan tombol kontrol, Anda akan mengontrol tindakan sang pahlawan. Dia harus berjalan mengelilingi ruangan dan memeriksa semuanya dengan cermat. Cari bagian jam yang akan disembunyikan di mana-mana. Ingatlah bahwa Pembuat Jam berkeliaran di sekitar rumah. Anda harus membantu sang pahlawan melarikan diri darinya. Segera setelah semua bagian jam terkumpul, Anda dapat membangunkan Robin dan untuk itu Anda akan diberikan poin dalam game Brother Wake Up.