Di kota metropolitan yang besar, telah terjadi beberapa kecelakaan pada jalur pipa yang dilalui air masuk ke kota. Anda di game Pipes: The Puzzle harus memperbaiki pipa. Area tertentu akan terlihat di layar di depan Anda. Pipa akan berada di bawah tanah. Dengan mouse Anda dapat memutar beberapa di antaranya di ruang angkasa. Tugas Anda adalah mengekspos pipa agar terhubung satu sama lain. Segera setelah seluruh pipa pulih, air akan mengalir melewatinya. Begitu memasuki kota, Anda akan diberikan poin di game Pipes: The Puzzle dan Anda akan melanjutkan untuk memperbaiki bagian selanjutnya.