Alam semesta yang paling berbeda, satu demi satu, ditangkap oleh monster toilet Skibidi. Mario dengan cermat mengikuti berita tersebut dan memahami bahwa cepat atau lambat mereka akan sampai ke Kerajaan Jamur. Dia memutuskan untuk mencegah hal ini dan pergi ke dunia yang direbut untuk menghancurkan penjahat di sana. Dia memutuskan ini karena suatu alasan, pahlawan kita bertugas di intelijen untuk waktu yang lama, meskipun hanya sedikit orang yang mengetahuinya, dan memiliki semua keterampilan yang diperlukan. Pahlawan akan menemukan dirinya berada di wilayah yang telah direbut monster Skibidi. Seorang tukang ledeng dengan keterampilan mata-mata harus mengintai area tersebut dan berusaha membuat segalanya setenang mungkin. Namun, keheningan total tidak bisa dicapai. Kontrol gerakannya dengan panah. Dalam perjalanan akan ada rintangan yang harus Anda lewati. Tabrakan tidak dapat dihindari dan ada baiknya mempersiapkannya terlebih dahulu untuk menyerang dari posisi yang paling nyaman. Milik Anda tidak akan bisa menggunakan senjata, karena tembakan keras akan menarik perhatian yang tidak perlu kepada orang tersebut. Terlibat dalam pertarungan tangan kosong dengan musuh, serang dengan tombol Z dan bergerak maju di Toilet Super Spy Mario VS Skibidi. Setiap level yang diselesaikan akan dihargai dan Anda akan dapat memperkuat Mario.
