Setelah serangkaian kegagalan di Skibidi Land, toilet memutuskan untuk menggunakan taktik baru dalam permainan Skibidi Strike. Akibatnya, mereka memutuskan untuk melakukan konspirasi kriminal dengan teroris dan bersatu dengan mereka di bawah bendera yang sama. Para penjahat menemui mereka di tengah jalan, tidak curiga bahwa mereka sendiri akan menjadi monster toilet yang sama. Namun demikian, Skibidi terletak di salah satu pangkalan di tengah gurun dan sekarang Anda, sebagai bagian dari kelompok pasukan khusus, akan pergi ke sana untuk melenyapkan mereka. Pertama-tama, Anda perlu memilih amunisi dan senjata untuk pahlawan Anda. Setelah ini, Anda akan menyerbu pangkalan. Anda perlu bergerak di sekitar wilayah secara diam-diam, untuk ini Anda dapat menggunakan berbagai bangunan, kotak, dan benda lainnya. Segera setelah monster muncul di bidang pandang Anda, bidik dan tembak mereka. Untuk setiap musuh yang Anda bunuh, Anda akan diberikan sejumlah poin tertentu, yang dapat Anda gunakan untuk mengisi kembali amunisi dan meningkatkan senjata Anda. Penjahat juga dapat memberikan berbagai bonus berguna dan kotak P3K yang akan membantu Anda memulihkan kesehatan pahlawan Anda. Segera setelah Anda membersihkan lokasi yang ditentukan sepenuhnya, Anda dapat melanjutkan ke level berikutnya dalam game Skibidi Strike.
