Seorang pria dengan kekuatan super Spider-Man pergi untuk bertugas di intelijen asing dan menjadi agen khusus seperti James Bond. Tapi dia tidak membutuhkan senjata; dia mampu menghadapi musuh-musuhnya. Apa yang melepaskan jaring dari haluan dan menjerat musuh dengannya, melumpuhkannya sepenuhnya. Di Mutant Assassin 3D, Anda akan membantu pahlawan menyelesaikan misi dengan menghilangkan agen musuh yang tidak diinginkan. Mekanisme penghancurannya sederhana: Anda mengarahkan lingkaran hijau ke penjahat merah berikutnya dan melepaskan jaringnya. Ia membungkus tubuh dan musuh dikalahkan. Dengan cara yang sama, Anda perlu mengumpulkan tumpukan uang, mereka harus dikumpulkan untuk menyelesaikan level di Mutant Assassin 3D.
