Steve dan Alex harus bekerja sama lagi untuk membersihkan dunia mereka dari monster hitam yang muncul secara tak terduga di Steve dan Alex TheEnd. Monster mulai bermunculan di tempat-tempat di mana tidak ada satupun sinar matahari yang mencapai dan kegelapan total menguasai. Dari sana, makhluk gelap keluar dan mulai menyerang penghuni Minecraft. Teman-teman mempersenjatai diri dan pergi ke tempat mereka melihat monster untuk menghabisi mereka. Kalian harus membantu para hero dengan bermain bersama partner dan saling mendukung. Monster tidak dapat dilihat dalam kegelapan, mereka berbaur di dalamnya, jadi berhati-hatilah saat melewati area tersebut. Lebih baik lagi, tembak mereka untuk memastikannya. Tujuannya adalah untuk sampai ke Monumen di Steve dan Alex TheEnd.
