Jika kamu mengikuti petualangan seorang siswa Sekolah Misteri bernama Phil, kamu pasti tahu kalau dia diculik oleh kapal asing. Tentunya Anda mencoba membantunya. Namun, ternyata semuanya tidak terlalu buruk. Pahlawan tersebut ternyata berguna bagi awak kapal alien dan dengan cepat bergabung dengan tim. Dalam game Riddle Transfer Anda akan bertemu dengannya dan teman-teman barunya. Kapal itu baru saja menuju ke Bumi, namun tiba-tiba kendali hilang, seseorang mengendalikan kapal dari luar dan mendaratkan secara paksa di salah satu pangkalan rahasia. Pria berbaju hitam bersenjata membawa semua penumpang kapal dan menempatkan masing-masing di ruangan terpisah. Anda akan membantu Phil dalam Riddle Transfer, dan dia akan dapat membantu yang lain.
