Ninja tersebut belajar dalam waktu yang lama dan akhirnya tiba saatnya untuk menggunakan ilmu dan keterampilannya dalam Dark Ninja Hanjo. Sensei memberi tahu muridnya bahwa dia siap untuk memulai hidup mandiri, namun di saat yang sama, mantan muridnya diminta untuk menjalankan misi yang sangat penting untuk memulihkan kota. Misi tersebut akan menunjukkan seberapa siap sang pahlawan. Kota ini dikuasai oleh kegelapan; untuk membebaskannya, Anda harus melawan iblis atau prajurit yang kerasukan. Ninja akan mampu menunjukkan kemampuannya. Menerima instruksi dari guru; pada tahap awal, dia akan menemani muridnya, tetapi kemudian Anda harus bertindak sendiri di Dark Ninja Hanjo.
