Senjata ampuh di Voxel Mega Shooter dirancang untuk melawan monster berpiksel yang akan menyerang Anda di setiap level. Pistolnya cukup berubah-ubah; ia akan bergerak sendiri dalam bidang horizontal, dan Anda hanya bisa memberinya perintah untuk menembak. Mungkin ada rintangan bulat antara senjata dan target; hal itu dapat menghalangi atau membantu Anda. Gunakan pantulan, arahkan tembakan ke arah rintangan, sehingga peluru akhirnya mencapai monster dan hancurkan secara bertahap. Segera setelah piksel terakhir jatuh, Anda akan mendapatkan akses ke gambar baru dan rintangan baru akan muncul di Voxel Mega Shooter.