Segala jenis kegiatan memerlukan profesionalisme, namun dalam beberapa profesi juga perlu memperhatikan aspek moral tertentu, dan ini berlaku khususnya pada berbagai perkembangan ilmu pengetahuan yang dapat merugikan masyarakat. Pahlawan permainan Secret Lab Chronicles, Profesor Benjamin, menerima tawaran menggiurkan untuk bekerja di laboratorium swasta pada beberapa eksperimen rahasia. Dia memutuskan untuk setuju, tetapi ketika dia mulai bekerja, dia menyadari bahwa jika eksperimennya berhasil, umat manusia akan menghadapi ancaman lain berupa munculnya senjata yang tidak dapat dibandingkan dengan senjata yang sudah ada. Pahlawan ingin mengungkap semua orang yang berada di balik pembuatan dan pengoperasian laboratorium, tetapi dia membutuhkan bukti dan Anda harus mengumpulkannya di Secret Lab Chronicles.
