Para ilmuwan di seluruh dunia, masing-masing di bidangnya masing-masing, bekerja tanpa kenal lelah untuk menghasilkan penemuan hebat. Namun, hanya sedikit yang berhasil; sebagian besar studi masih belum selesai. Pendanaan mereka ditutup karena kurangnya prospek atau kegagalan dalam eksperimen. Pahlawan dari game Library Mysteries adalah mahasiswa salah satu universitas terkenal. Amelia, Candice, dan Ava sangat menyukai sains dan ingin menjadi terkenal. Mereka mengetahui bahwa salah satu profesor di institusi mereka terlibat dalam pengembangan ilmiah yang serius, tetapi proyek tersebut ditutup dan profesor tersebut menghilang. Para gadis ingin menemukan karyanya di perpustakaan universitas dan mempelajarinya. Bantu gadis-gadis di Misteri Perpustakaan.