Pernyataan bahwa semakin banyak otak maka semakin pintar seseorang adalah salah, namun pahlawan game Braininess 2 tidak mempercayai hal tersebut dan ingin mengumpulkan otak sebanyak-banyaknya. Dia yakin setelah ini dia akan menjadi sangat pintar. Tidak perlu mengecewakannya, cukup bantu sang pahlawan menyelesaikan tugasnya. Di setiap level, Anda perlu memandu karakter di sepanjang ubin putih, mengumpulkan otak, dan berhenti di ubin kuning terakhir. Prasyarat untuk menyelesaikan suatu level adalah mengumpulkan semua otak. Ingatlah bahwa sekali Anda menginjak ubin, ubin itu akan hilang, jadi tidak ada jalan kembali. Rencanakan rute Anda agar tidak membuat kesalahan di Braininess 2.
