Peternakanmu di Farmers Versus Aliens berada dalam ancaman serius dari luar angkasa. Untuk beberapa alasan, alien dari galaksi yang jauh memutuskan untuk menculik hewan dari peternakan Anda, dan ini sama sekali tidak baik. Tidak ada yang bisa menjelaskan hilangnya makhluk hidup; siapa yang percaya bahwa alien mencuri sapi, domba, babi, dan kuda. Anda harus menyembunyikannya dan untuk melakukan ini, Anda harus membantu petani mengarahkan setiap hewan ke area segitiga hijau tempat hewan yang bersangkutan digambar. Ini akan menyembunyikan semua makhluk hidup Anda dari pandangan alien. Tapi cepatlah, kalau tidak mereka akan memulai Operasi Petani Versus Alien.
